数学系现有教师21人，其中具有正高级职称3名，副高级职称8人、讲师10人，博士7人。数学系现有数学与应用数学1个本科专业，本专业按数学与应用数学大类招生，下设计算金融学，计算生物学两个方向，均为随计算机技术发展形成的新兴学科方向。专业主要培养具有良好的科学素养，掌握数学科学的基本理论和原理，能运用现代数学方法和计算机技术从事研究、开发和实际应用的中高级复合型科学技术人才，专业跨度大，理论基础扎实，就业适应面广。
数学系下设云南农业大学大学计算金融研究中心，研究中心主要研究金融大数据与智能决策支持技术、计算金融与风险管理，涉及金融数学、金融工程、计算机技术、量化投资与高频交易等学科领域，通过学科交叉，融合创新。中心以数学与应用数学本科专业计算金融方向为平台，每年拟招收60名左右的本科生。研究中心现有计算金融研究团队紧密跟踪金融学前沿研究方法，立足于中国的金融市场，已开展了一系列研究。研究团队在公司金融、金融风险计量与控制等方面的研究具有鲜明的特色。近年来，在学术研究方面，团队已主持或参与国家基金9项，教育部基金2项，省基金4项，地厅级基金8项，在国内外重要的学术期刊上发表高水平论文80余篇（其中SCI、EI收录20余篇）、出版专著1部，教材6部。
         多年来数学系主要承担数学与应用数学专业人才培养外，还承担全校理学、工学、农学、经管类等专业相应数学课程，完成学校精品课程建设1门、重点课程建设3门、主持校级一类课程5门，现有主编、参编教材13部，自主开发学习平台软件专利1项，发表教学科研文章100余篇，专业成立以来每年均组织学生参加全国大学生数学建模大赛，获多项国家级省级奖项。